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環(huán)球關(guān)注:追溯癌癥的祖先 新軟件從腫瘤遺傳物質(zhì)準(zhǔn)確推斷血統(tǒng)

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日期:2023-01-03 17:33:41    來源:科技日報    


(資料圖片)

科技日報記者?張夢然

美國冷泉港實(shí)驗(yàn)室研究人員正在努力揭示癌癥與種族/民族之間的家譜聯(lián)系。他們開發(fā)的新軟件,可從腫瘤DNA和RNA中準(zhǔn)確推斷出血統(tǒng)。這些工作還可幫助臨床醫(yī)生制定早期癌癥檢測和個性化治療的新策略。研究成果近日發(fā)表在《癌癥研究》雜志上。

知道祖先來自哪里,會是更好的癌癥治療關(guān)鍵嗎?答案可能存在于包含數(shù)十萬份腫瘤樣本的龐大數(shù)據(jù)庫和醫(yī)院檔案中。

研究人員表示,為什么不同種族/民族的人對不同癌癥的患病率不同?可能是他們有不同的習(xí)慣、生活條件等各種社會和環(huán)境因素,但也可能有遺傳成分。

研究團(tuán)隊(duì)使用混合DNA圖譜訓(xùn)練其軟件工具,從已知背景的癌性和無癌癥基因組中創(chuàng)建這些圖譜。然后,他們測試了該軟件中已知血統(tǒng)患者的胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌和血癌標(biāo)本的性能。研究發(fā)現(xiàn)該軟件能以超過95%的準(zhǔn)確率將創(chuàng)建的混合圖譜與種群相匹配。

研究團(tuán)隊(duì)還加入了一項(xiàng)結(jié)直腸癌聯(lián)合研究。該研究使他們能夠探索結(jié)直腸癌如何根據(jù)特定種族/民族以不同的方式突變基因。他們希望進(jìn)一步完善這一軟件,未來不僅推斷出整個基因組的祖先,還能推斷其中每個序列的祖先。

研究人員稱,如果能夠識別出更易患癌癥或其他侵入性疾病的祖先,軟件將可幫助確定基因組中負(fù)責(zé)癌癥的特定部分并進(jìn)行靶向治療。“現(xiàn)在,一個簡單的DNA拭子可告訴你來自哪里,以及會遺傳哪些疾病。將來,它也可能給你打敗疾病的手段?!?/p>

癌癥與遺傳基因、生活習(xí)慣、生活環(huán)境等因素有著密切的關(guān)聯(lián),這些因素都可以成為研究癌癥的重要線索。順藤摸瓜地沿著這些線索去探尋癌癥的起因,都很有可能找到對癌癥的預(yù)防或治療富有價值的信息:如果發(fā)現(xiàn)某些生活習(xí)慣或生活環(huán)境容易招致癌癥,我們就可以提前避而遠(yuǎn)之;從遺傳基因的維度深究下去,則有助于從基因組中尋找對癌癥進(jìn)行靶向治療的關(guān)鍵信息。

關(guān)鍵詞: 遺傳物質(zhì)

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